Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARL4CP56559 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL4CP56559 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms