Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GFRA1P56159 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms