Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCKAP1LP55160 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms