Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRLP54845 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRLP54845 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRLP54845 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRLP54845 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NRLP54845 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRLP54845 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRLP54845 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRLP54845 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRLP54845 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRLP54845 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRLP54845 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRLP54845 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRLP54845 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRLP54845 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NRLP54845 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRLP54845 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRLP54845 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRLP54845 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRLP54845 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRLP54845 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRLP54845 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms