Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD23BP54727 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAD23BP54727 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms