Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATN1P54259 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATN1P54259 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATN1P54259 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATN1P54259 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATN1P54259 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATN1P54259 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATN1P54259 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATN1P54259 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATN1P54259 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATN1P54259 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATN1P54259 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATN1P54259 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATN1P54259 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATN1P54259 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATN1P54259 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATN1P54259 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATN1P54259 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATN1P54259 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATN1P54259 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATN1P54259 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATN1P54259 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATN1P54259 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATN1P54259 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATN1P54259 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATN1P54259 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATN1P54259 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATN1P54259 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATN1P54259 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATN1P54259 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATN1P54259 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms