Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARSP54136 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARSP54136 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RARSP54136 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARSP54136 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RARSP54136 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RARSP54136 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RARSP54136 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RARSP54136 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RARSP54136 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RARSP54136 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARSP54136 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RARSP54136 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RARSP54136 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARSP54136 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARSP54136 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARSP54136 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARSP54136 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARSP54136 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARSP54136 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RARSP54136 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARSP54136 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARSP54136 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARSP54136 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARSP54136 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARSP54136 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RARSP54136 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RARSP54136 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RARSP54136 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARSP54136 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARSP54136 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARSP54136 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARSP54136 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RARSP54136 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RARSP54136 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RARSP54136 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARSP54136 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARSP54136 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARSP54136 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARSP54136 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARSP54136 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RARSP54136 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RARSP54136 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RARSP54136 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARSP54136 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARSP54136 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARSP54136 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARSP54136 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARSP54136 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms