Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLNS1AP54105 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLNS1AP54105 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms