Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPAP53621 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPAP53621 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPAP53621 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPAP53621 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPAP53621 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPAP53621 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPAP53621 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPAP53621 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPAP53621 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPAP53621 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPAP53621 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms