Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACLYP53396 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACLYP53396 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACLYP53396 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACLYP53396 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACLYP53396 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACLYP53396 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACLYP53396 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACLYP53396 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACLYP53396 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACLYP53396 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACLYP53396 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACLYP53396 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACLYP53396 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACLYP53396 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACLYP53396 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACLYP53396 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACLYP53396 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACLYP53396 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACLYP53396 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACLYP53396 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACLYP53396 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACLYP53396 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACLYP53396 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACLYP53396 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACLYP53396 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACLYP53396 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACLYP53396 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACLYP53396 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms