Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HK3P52790 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HK3P52790 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HK3P52790 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HK3P52790 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HK3P52790 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HK3P52790 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HK3P52790 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HK3P52790 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HK3P52790 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HK3P52790 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HK3P52790 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HK3P52790 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HK3P52790 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HK3P52790 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms