Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KPNA1P52294 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KPNA1P52294 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms