Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN3P51790 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN3P51790 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms