Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB27AP51159 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB27AP51159 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB27AP51159 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms