Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
BCAMP50895 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BCAMP50895 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BCAMP50895 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BCAMP50895 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCAMP50895 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAMP50895 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAMP50895 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAMP50895 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAMP50895 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAMP50895 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAMP50895 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BCAMP50895 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCAMP50895 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BCAMP50895 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAMP50895 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAMP50895 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAMP50895 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BCAMP50895 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BCAMP50895 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCAMP50895 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAMP50895 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAMP50895 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BCAMP50895 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCAMP50895 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms