Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RARRES1P49788 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RARRES1P49788 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms