Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSEN1P49768 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSEN1P49768 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms