Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSNK1EP49674 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms