Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPINT3P49223 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPINT3P49223 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms