Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLCP48506 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLCP48506 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLCP48506 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLCP48506 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLCP48506 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLCP48506 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLCP48506 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLCP48506 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLCP48506 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLCP48506 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLCP48506 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GCLCP48506 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLCP48506 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLCP48506 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCLCP48506 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCLCP48506 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCLCP48506 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCLCP48506 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCLCP48506 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GCLCP48506 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCLCP48506 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCLCP48506 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCLCP48506 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms