Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX9P48436 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX9P48436 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX9P48436 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX9P48436 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX9P48436 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX9P48436 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX9P48436 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX9P48436 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX9P48436 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX9P48436 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX9P48436 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX9P48436 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX9P48436 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX9P48436 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX9P48436 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms