Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGRP47804 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGRP47804 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGRP47804 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGRP47804 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGRP47804 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGRP47804 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGRP47804 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGRP47804 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGRP47804 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RGRP47804 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGRP47804 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGRP47804 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGRP47804 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGRP47804 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGRP47804 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms