Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPZBP47756 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZBP47756 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms