Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPL28P46779 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL28P46779 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL28P46779 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RPL28P46779 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RPL28P46779 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPL28P46779 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL28P46779 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RPL28P46779 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPL28P46779 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RPL28P46779 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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