Protein–RNA interactions for Protein: P46108

CRK, Adapter molecule crk, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKP46108 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRKP46108 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CRKP46108 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRKP46108 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CRKP46108 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRKP46108 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRKP46108 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRKP46108 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRKP46108 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRKP46108 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRKP46108 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRKP46108 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CRKP46108 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRKP46108 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms