Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOP2P46087 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NOP2P46087 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOP2P46087 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOP2P46087 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOP2P46087 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOP2P46087 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOP2P46087 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOP2P46087 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOP2P46087 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NOP2P46087 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOP2P46087 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOP2P46087 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOP2P46087 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOP2P46087 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOP2P46087 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOP2P46087 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NOP2P46087 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP2P46087 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms