Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTGER2P43116 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTGER2P43116 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTGER2P43116 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms