Protein–RNA interactions for Protein: P38996

NAB3, Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 3, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NAB3	P38996	MED2	YDL005C	1296 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	NUP42	YDR192C	1293 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	GLO2	YDR272W	825 nt		5.02	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
NAB3	P38996	YMR085W	YMR085W	1299 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	YNR071C	YNR071C	1029 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	PSF3	YOL146W	585 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	SPS4	YOR313C	1017 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	TDA3	YHR009C	1572 nt		5.02	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	RSC3	YDR303C	2658 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	POL31	YJR006W	1464 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	RML2	YEL050C	1182 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	DUO1	YGL061C	744 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	YGR219W	YGR219W	342 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	ADD66	YKL206C	804 nt		5.01	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
NAB3	P38996	MSA2	YKR077W	1092 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	EOS1	YNL080C	1101 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	IDH2	YOR136W	1110 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	GEM1	YAL048C	1989 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	TEF1	YPR080W	1377 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	TEF2	YBR118W	1377 nt		5.01	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	PAN1	YIR006C	4443 nt		5	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	MSS2	YDL107W	1056 nt		5	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	YDR154C	YDR154C	351 nt		5	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
NAB3	P38996	NQM1	YGR043C	1002 nt		5	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	PEX21	YGR239C	867 nt		5	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	ERG3	YLR056W	1098 nt		5	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	BMT2	YBR141C	1014 nt		5	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	MNR2	YKL064W	2910 nt		5	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	POL1	YNL102W	4407 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	SEC12	YNR026C	1416 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	GCS1	YDL226C	1059 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	NSE3	YDR288W	912 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	ERD1	YDR414C	1089 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	YNG2	YHR090C	849 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	EGD2	YHR193C	525 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	CTR1	YPR124W	1221 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	FLC1	YPL221W	2382 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.99	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	HMG1	YML075C	3165 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	ARC15	YIL062C	465 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	MND2	YIR025W	1107 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	TMA16	YOR252W	537 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	MET16	YPR167C	786 nt		4.98	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	TAF8	YML114C	1533 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	IRC6	YFR043C	714 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	EDC1	YGL222C	528 nt		4.97	□□□□□ -1.61	RIP-Chip
NAB3	P38996	GTF1	YGR102C	552 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	YUH1	YJR099W	711 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	PGA3	YML125C	939 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	HEK2	YBL032W	1146 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	DCC1	YCL016C	1143 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	SHE10	YGL228W	1734 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	MCP2	YLR253W	1710 nt		4.97	□□□□□ -1.61
NAB3	P38996	SLM5	YCR024C	1479 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	SLT2	YHR030C	1455 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YDL172C	YDL172C	480 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YOR186W	YOR186W	435 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YOR200W	YOR200W	399 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	FDC1	YDR539W	1512 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.96	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	GCD1	YOR260W	1737 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	VPS27	YNR006W	1869 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	MTQ2	YDR140W	666 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	BET1	YIL004C	429 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RUF21	RUF21	707 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RPL18B	YNL301C	561 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RPL18A	YOL120C	561 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	TMC1	YOR052C	453 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	MMP1	YLL061W	1752 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	NUG1	YER006W	1563 nt		4.95	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RCR2	YDR003W	633 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RPS18A	YDR450W	441 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	HSP31	YDR533C	714 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YGL118C	YGL118C	438 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	ERV29	YGR284C	933 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	BAT2	YJR148W	1131 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	MRPL22	YNL177C	930 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RCL1	YOL010W	1104 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YPR195C	YPR195C	330 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	snR34	snR34	203 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YLR152C	YLR152C	1731 nt		4.94	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	ATM1	YMR301C	2073 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	MNN10	YDR245W	1182 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	PRP3	YDR473C	1410 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	SCL1	YGL011C	759 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YGR022C	YGR022C	330 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	TRS33	YOR115C	807 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	YOR314W	YOR314W	330 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	FES1	YBR101C	873 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	DIP2	YLR129W	2832 nt		4.93	□□□□□ -1.62
NAB3	P38996	RSC30	YHR056C	2652 nt		4.93	□□□□□ -1.62

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