Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GGCXP38435 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GGCXP38435 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GGCXP38435 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GGCXP38435 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GGCXP38435 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGCXP38435 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGCXP38435 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGCXP38435 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGCXP38435 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGCXP38435 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GGCXP38435 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GGCXP38435 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GGCXP38435 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GGCXP38435 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms