Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 snR189snR189 189 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 MAK3YPR051W 531 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TRS85YDR108W 2097 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 FZO1YBR179C 2568 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RGP1YDR137W 1992 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 IMD3YLR432W 1572 nt4.02□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PRD1YCL057W 2139 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CAB3YKL088W 1716 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ALD3YMR169C 1521 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ALD2YMR170C 1521 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 GGA1YDR358W 1674 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PTC1YDL006W 846 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RPC53YDL150W 1269 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RRG1YDR065W 1098 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CIR1YGR207C 786 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 IMP3YHR148W 552 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 SYN8YAL014C 768 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YLR225CYLR225C 1224 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YMR178WYMR178W 825 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CSL4YNL232W 879 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CUS2YNL286W 858 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ZPS1YOL154W 750 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YOR200WYOR200W 399 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YOR318CYOR318C 306 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PDX3YBR035C 687 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 MUP3YHL036W 1641 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 FRS1YLR060W 1788 nt4.01□□□□□ -1.77
AVT5P38176 KAR5YMR065W 1515 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 THI21YPL258C 1656 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 GMC1YDR506C 1827 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CUS1YMR240C 1311 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 SIR1YKR101W 1965 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YHL012WYHL012W 1482 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TGL1YKL140W 1647 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YGR182CYGR182C 354 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 HPM1YIL110W 1134 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RPB4YJL140W 666 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TFA2YKR062W 987 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 HRT3YLR097C 1035 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 OCT1YKL134C 2319 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 MNN1YER001W 2289 nt4□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RSC30YHR056C 2652 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 IZH3YLR023C 1632 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 NUR1YDL089W 1455 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RRP14YKL082C 1305 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PRP9YDL030W 1593 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ARP2YDL029W 1176 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YDR282CYDR282C 1245 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PRO3YER023W 861 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 PPE1YHR075C 1203 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 MRPL13YKR006C 795 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TVP38YKR088C 1014 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CUZ1YNL155W 825 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 SAM4YPL273W 978 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TOG1YER184C 2385 nt3.99□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ASA1YPR085C 1332 nt3.98□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CNA1YLR433C 1662 nt3.98□□□□□ -1.77
AVT5P38176 GEP7YGL057C 864 nt3.98□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ERG29YMR134W 714 nt3.98□□□□□ -1.77
AVT5P38176 KCC4YCL024W 3114 nt3.98□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TCM62YBR044C 1719 nt3.98□□□□□ -1.77
AVT5P38176 CDC15YAR019C 2925 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 snR63snR63 255 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 KNH1YDL049C 807 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 SPR28YDR218C 1272 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 POP6YGR030C 477 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 DCD1YHR144C 939 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YIL089WYIL089W 618 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 YLR326WYLR326W 723 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TPP1YMR156C 717 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 THI80YOR143C 960 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 ATG29YPL166W 642 nt3.97□□□□□ -1.77
AVT5P38176 RKM2YDR198C 1440 nt3.96□□□□□ -1.77
AVT5P38176 TED1YIL039W 1422 nt3.96□□□□□ -1.77
AVT5P38176 COS7YDL248W 1152 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 DON1YDR273W 1098 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 MHR1YDR296W 681 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 MLC1YGL106W 450 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 COS5YJR161C 1152 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 EBP2YKL172W 1284 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 YLR125WYLR125W 411 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 LTO1YNL260C 597 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 YOL162WYOL162W 648 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 GSP2YOR185C 663 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 MRM1YOR201C 1239 nt3.96□□□□□ -1.78
AVT5P38176 TPO2YGR138C 1845 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 AVT1YJR001W 1809 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 RAD7YJR052W 1698 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 ACT1YFL039C 1128 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 THI5YFL058W 1023 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 CLC1YGR167W 702 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 PAN5YHR063C 1140 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 NSG1YHR133C 876 nt3.95□□□□□ -1.78
AVT5P38176 LAC1YKL008C 1257 nt3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.5 ms