Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX5P35711 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOX5P35711 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOX5P35711 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SOX5P35711 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX5P35711 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX5P35711 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX5P35711 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX5P35711 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX5P35711 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX5P35711 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX5P35711 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX5P35711 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX5P35711 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX5P35711 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX5P35711 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX5P35711 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX5P35711 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX5P35711 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX5P35711 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX5P35711 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX5P35711 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX5P35711 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX5P35711 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX5P35711 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX5P35711 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX5P35711 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms