Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT9P35527 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT9P35527 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT9P35527 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT9P35527 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT9P35527 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT9P35527 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT9P35527 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT9P35527 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT9P35527 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT9P35527 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT9P35527 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT9P35527 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT9P35527 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT9P35527 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT9P35527 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT9P35527 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT9P35527 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms