Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFC1P35251 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFC1P35251 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC1P35251 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFC1P35251 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFC1P35251 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC1P35251 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC1P35251 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC1P35251 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC1P35251 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC1P35251 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC1P35251 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RFC1P35251 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC1P35251 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC1P35251 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC1P35251 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC1P35251 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC1P35251 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC1P35251 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC1P35251 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC1P35251 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC1P35251 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC1P35251 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC1P35251 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC1P35251 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC1P35251 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC1P35251 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC1P35251 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC1P35251 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC1P35251 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC1P35251 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC1P35251 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFC1P35251 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC1P35251 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFC1P35251 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms