Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCGF2P35227 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PCGF2P35227 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms