Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GJA4P35212 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJA4P35212 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJA4P35212 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJA4P35212 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJA4P35212 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJA4P35212 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJA4P35212 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms