Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP2C19P33261 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP2C19P33261 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms