Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP1P32455 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP1P32455 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP1P32455 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP1P32455 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP1P32455 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP1P32455 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP1P32455 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP1P32455 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GBP1P32455 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GBP1P32455 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GBP1P32455 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP1P32455 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP1P32455 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP1P32455 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP1P32455 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GBP1P32455 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GBP1P32455 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP1P32455 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP1P32455 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP1P32455 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP1P32455 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP1P32455 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP1P32455 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP1P32455 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP1P32455 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms