Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC8A1P32418 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC8A1P32418 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms