Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OTX2P32243 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OTX2P32243 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTX2P32243 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTX2P32243 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTX2P32243 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
OTX2P32243 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OTX2P32243 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTX2P32243 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTX2P32243 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTX2P32243 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
OTX2P32243 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTX2P32243 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTX2P32243 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OTX2P32243 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OTX2P32243 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OTX2P32243 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OTX2P32243 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX2P32243 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms