Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCKBRP32239 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKBRP32239 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms