Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXD11P31277 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD11P31277 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms