Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXC8P31273 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC8P31273 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms