Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC27P30260 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDC27P30260 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDC27P30260 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDC27P30260 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDC27P30260 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDC27P30260 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDC27P30260 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC27P30260 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC27P30260 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC27P30260 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC27P30260 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDC27P30260 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDC27P30260 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDC27P30260 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDC27P30260 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC27P30260 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC27P30260 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC27P30260 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC27P30260 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDC27P30260 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms