Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR1EP28566 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTR1EP28566 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTR1EP28566 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTR1EP28566 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR1EP28566 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTR1EP28566 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HTR1EP28566 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR1EP28566 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR1EP28566 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR1EP28566 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTR1EP28566 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTR1EP28566 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTR1EP28566 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR1EP28566 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR1EP28566 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTR1EP28566 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR1EP28566 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTR1EP28566 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTR1EP28566 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms