Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMO1P25800 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO1P25800 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO1P25800 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO1P25800 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO1P25800 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO1P25800 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO1P25800 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO1P25800 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO1P25800 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO1P25800 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO1P25800 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO1P25800 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMO1P25800 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMO1P25800 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMO1P25800 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
LMO1P25800 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMO1P25800 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO1P25800 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO1P25800 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO1P25800 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO1P25800 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO1P25800 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LMO1P25800 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms