Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP5F1P24539 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5F1P24539 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms