Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRGP23470 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
PTPRGP23470 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRGP23470 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
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