Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRBP23467 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRBP23467 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRBP23467 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRBP23467 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRBP23467 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRBP23467 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRBP23467 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRBP23467 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRBP23467 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRBP23467 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRBP23467 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRBP23467 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRBP23467 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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