Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGS1P23219 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGS1P23219 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS1P23219 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms