Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMPD1P23109 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMPD1P23109 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMPD1P23109 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMPD1P23109 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMPD1P23109 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMPD1P23109 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms